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科研賦能 | 非靶向代謝組學中的“火山圖”

活動日期：2025-07-15

火山圖是一種用于差異表達分析（如RNA-seq、蛋白質組學）的可視化工具，能夠直觀展示基因/蛋白的表達變化倍數(shù)（logFC）和統(tǒng)計學顯著性（pValue）。

在非靶向代謝組學研究中，火山圖是一種非常實用且常見的一種圖。

火山圖是散點圖的一種，主要是通過差異倍數(shù)(Fold Change)和P值結合的方式來展示篩選的差異代謝物。通過這種作圖形式展示，能夠方便直觀地展示兩個樣本之間的差異表達分布情況。

火山圖中每個點代表一個代謝物，橫坐標代表該組對比各物質的倍數(shù)變化（取以2為底的對數(shù)），縱坐標表示student's t檢驗的P-value（取以10為底的對數(shù)），散點大小代表OPLS-DA模型的VIP值，散點越大VIP值越大，篩選得到的差異表達代謝物越可靠。圖中綠色的點代表下調差異表達代謝物，紅色的點代表上調差異表達代謝物，黑色代表檢測到但差異不顯著的代謝物。


 火山圖的實際應用場景 

疾病標志物發(fā)現(xiàn)：識別與特定生理或病理狀態(tài)相關聯(lián)的新型潛在生物標志物。

發(fā)現(xiàn)差異代謝物：比較不同組別（如健康vs 疾病、處理 vs 對照、不同基因型）樣本的代謝譜，找出具有統(tǒng)計學顯著差異的代謝物（無論其身份是否已知）。

代謝通路富集分析：將差異代謝物映射到KEGG代謝通路，進行富集分析，識別顯著富集的通路（如氨基酸代謝、TCA循環(huán)）。

 火山圖與其他分析的結合 

PCA圖：展示樣本間的總體代謝差異（組內變異度）。

OPLS-DA圖：通過VIP值篩選差異代謝物，結合火山圖進一步驗證顯著性。

通路分析：差異代謝物富集到特定通路，揭示疾病相關機制。

 繪制火山圖的工具與方法 

MetaboAnalyst 等平臺

Python/R代碼


 斯坦德科研事業(yè)部

非靶向代謝組學服務優(yōu)勢

多平臺覆蓋能力

LC-MS：主力平臺Q-Exactive HF，覆蓋極性/中等極性代謝物。

GC-MS：揮發(fā)性代謝物及衍生化化合物。

雙平臺互補方案：提供LC-MS+GC-MS聯(lián)合分析，代謝物覆蓋度提升40%+。

樣本要求

組織/器官、糞便、腸道內容物：生物學重復3-6組，建議送樣量500mg，最低送樣量200mg，送樣條件：液氮速凍，干冰寄送。

血清、血漿：生物學重復3-6組，建議送檢量0.5mL， 最低送檢量0.1mL，送樣條件：液氮速凍，干冰寄送。

尿液、乳汁、腦脊液、淋巴液、唾液、汗液、血淋 ：生物學重復3-6組，建議送檢量0.5mL， 最低送檢量0.2mL，送樣條件：液氮速凍，干冰寄送。

關于斯坦德科研事業(yè)部

斯坦德科研事業(yè)部始終堅持以客戶為中心，為高校研究所、醫(yī)院、企業(yè)提供全方位的數(shù)據(jù)支撐。我們立足理論基礎研究，提供領先的組學技術服務及創(chuàng)新醫(yī)學樣本檢測產(chǎn)品應用，致力于成為科研行業(yè)的開拓者與引領者。以豐富的實踐經(jīng)驗、先進的儀器設備及卓越的專家團隊助力代謝組學、蛋白組學、基因組學、多組學聯(lián)合、動物建模、多糖結構解析等行業(yè)高質量發(fā)展。